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miércoles, 12 de marzo de 2014

Redescubren una súper bacteria que revolucionara el campo de la biotecnología en la Tierra y en Marte .Parte II extraído de la Wikipedia

Redescubren una súper bacteria que revolucionara el campo de la biotecnología en la Tierra y en Marte .Parte II extraído de la Wikipedia.

Gráfico molecular para MMDB ID 8014 biounit 1

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Structure/mmdb/mmdbsrv.cgi?uid=1a7v


Y diversos males del planeta tierra como la fijación del CO2 combatiendo el calentamiento climático y



 La   fijación natural del N2 produciendo abono natural;

Degrada hidrocarburos aromáticos cancerígenos y hará habitable el planeta Marte. etc.

 (El cable dice que se alimenta como el papa del increíble Hulk adsorbiendo energía)

Rhodopseudomonas palustris

http://en.wikipedia.org/wiki/Rhodopseudomonas_palustris

Rhodopseudomonas palustris es una gram-negativas bacterias púrpuras no del azufre , notables por su capacidad de cambiar entre cuatro modos diferentes de metabolismo.

R. palustris se ha encontrado para crecer en:

 lagunas porcina residuos,

 excrementos de lombrices de tierra,

sedimentos marinos y costeros del agua del estanque.

 Aunque las bacterias púrpuras no del azufre son normalmente photoheterotrophic, R. palustris tiene la capacidad de cambiar entre los cuatro modos diferentes de metabolismo que sostienen la vida: photoautotrophic ,
foto heterótrofos ,
chemoautotroph y
chemoheterotrophic.

Esto significa que esta bacteria puede crecer con o sin oxígeno , sino que puede utilizar la luz, compuestos inorgánicos, o compuestos orgánicos para la energía, sino que puede adquirir de carbono de cualquiera de fijación del dióxido de carbono o de compuestos derivados de plantas verdes, y también puede fijar el nitrógeno .

Esta versatilidad metabólica ha despertado interés en la comunidad de investigación y hace que esta bacteria adecuada para su uso potencial en la biotecnología aplicaciones.

Se están realizando esfuerzos para entender cómo este organismo integra los distintos módulos metabólicos en respuesta a los cambios ambientales.
El genoma completo de la cepa Rhodopseudomonas palustris CGA009 fue secuenciado ( Lista de los genomas bacterianos secuenciados ) con la esperanza de obtener más información sobre cómo la bacteria detecta los cambios ambientales y la forma en que regula sus vías metabólicas en consecuencia.

[ 1 ] Se encontró que R. palustris tiene genes que codifican para las proteínas que conforman los complejos captadores de luz y centros de reacción fotosintéticos .

Complejos captadores de luz y centros de reacción fotosintéticos se encuentran típicamente en los organismos fotosintéticos como las verdes plantas .
 Además de ser un bacterias fotosintéticas R. palustris pueden modular la fotosíntesis de acuerdo a la cantidad de luz disponible.

Por ejemplo, en circunstancias de poca luz responde al aumentar el nivel de estos captadores de luz (LH) complejos que permiten la absorción de la luz. R. palustris también tiene los genes que codifican para la proteína RUBISCO , una enzima que es necesaria para el dióxido de carbono de fijación (véase la fijación de carbono ) que se encuentra en plantas y otros organismos fotosintéticos.

 El genoma revela también la existencia de proteínas implicadas en la fijación de nitrógeno (ver diazótrofo ).

Bacterias fototróficas púrpuras son de gran interés debido a su uso en aplicaciones biotecnológicas.

 Estas bacterias se pueden utilizar para la síntesis 'bioplástico' y de hidrógeno de producción. R. palustris se diferencia de otras bacterias púrpuras, debido a que es capaz de modular la fotosíntesis de acuerdo a la cantidad de luz disponible y su capacidad de degradar aromáticos compuestos que se encuentran en los residuos agrícolas e industriales.

También tiene la característica única de codificación para una que contiene vanadio nitrogenasa , que produce como un subproducto de la fijación de nitrógeno tres veces más hidrógeno que el nitrogenasa de otras bacterias (nitrogenasa que contiene molybennum-). El potencial para manipular R. palustris para ser utilizado como fuente de producción de hidrógeno y la biodegradación todavía requiere un conocimiento más detallado de sus vías metabólicas y los mecanismos de regulación. [ 1 ]

…………………
RuBisCO
http://es.wikipedia.org/wiki/RuBisCO




File:RuBisCOL2S2.png

Estructura de la rubisco de eucariotas mostrando la organización de las cadenas grandes (blanco y gris) y pequeñas (azul y naranja).





Estructura de la RuBisCO de las bacterias, con dos subunidades grandes y dos pequeñas.
RuBisCO es una enzima de oxígeno que se encuentra en el cloroplasto de los organismos autótrofos, denominada de una manera mas simple como oxigenasa

Fijación del carbono[editar]

La RuBisCO cataliza el primer paso y más significativo del Ciclo de Calvin, en concreto de la fijación del dióxido de carbono a una forma orgánica.

En la reacción, una molécula de CO2 se une a la cadena hidrocarbonada de la ribulosa-1,5-bisfosfato, una pentosa activada energéticamente por la fosforilación de los dos carbonos situados en los extremos de la cadena. A través de un estado de transición de seis carbonos, se forman dos moléculas de ácido 3-fosfoglicérico:

Ribulosa-1,5-bisfosfato + CO2 + H2O \rightleftharpoons  2 3-fosfoglicerato + 2 H+

El ciclo de Calvin y la fijación del CO2 por la RuBisCO son propios de todos los organismos autótrofos.
No se dan sólo en fotosintetizadores típicos, como cianobacterias, algas eucarióticas y plantas, que realizan la fotosíntesis oxigénica, sino también en arqueas y bacterias dotadas de metabolismos fotosintetizadores o quimiosintetizadores diversos.

 La RuBisCO es responsable de la producción primaria de la que parte la circulación de energía en la biosfera.
La reacción de fijación del carbono es en sí extremadamente ineficiente; y lo es más aún por la competencia con la función de oxigenasa.
Actividad oxigenasa e ineficiencia[editar]

La RuBisCO cataliza también la fijación de O2 sobre la ribulosa-1,5-bisfosfato, en un proceso llamado fotorrespiración, que termina liberando CO2 y disipando energía.

 La concentración de O2 es en la atmósfera es 6.000 veces mayor que la de CO2, lo que favorece a la fotorrespiración. No obstante, incluso con la mayor concentración de oxígeno presente, la enzima es capaz de secuestrar 3-4 moléculas de dióxido de carbono por cada una de oxígeno. La ineficiencia de la RuBisCo la convierte, en condiciones normales, en el factor limitante de la fotosíntesis. Actualmente se investiga como modificar genéticamente la enzima para favorecer la productividad agrícola.1

 Nota del autor del blog :del artículo dice que como vive con o sin oxigeno y que puede fijar CO2 esto puede ser muy útil en Marte donde abunda el CO2 y no compite con su otra función de oxigeno pues allí no hay oxigeno.
 Como también fija el nitrógeno seria algo así como las ribosomas de las legumbres que fijan nitrógeno del aire sin tener que fabricar abonos sintéticos que producen calentamiento climático pues en su producción se utiliza mucha energía que a su vez es provista con combustibles fósiles.

Además del artículo anterior que dice que como se alimenta de electricidad esto quiere decir que degrada los compuestos aromáticos como el benzopireno  los cuales son ricos en nubes electrónicas de electrones SP2 o los bifenilos clorados etc. purificando el ambiente agrícola,  útil por  ejemplo  para  Vietnan para combatir el agente naranja que contamino sus suelos durante la guerra con EEUU, y para china donde sus suelos están contaminados por el descuido industrial.

También seria de mucha utilidad en EEUU donde la técnica del Fraking esta contaminando los suelos no solo con minerales nocivos sino con otros hidrocarburos aromáticos de los  cuales se alimenta .



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